蒙牛不断拓宽产品品类，升级产品营养配方，推出有机、低糖、低钠、低脂、减少人工成分、解决营养缺乏问题、替代蛋白及小份量产品等多样化的创新产品。2021年6月，蒙牛发布《蒙牛营养健康政策（2021-2025）》，全面推进营养健康工作。蒙牛与中国农业大学、清华大学、北京大学、中国科学院等16家国内外顶尖高校和研究机构合作，建立世界领先水平的“高科技研究院暨高智能化生产基地”和1座海外研发中心，拥有全球超过30余个研发合作伙伴。2022年，蒙牛持续与中国农业大学、清华大学、中国检科院等院校开展合作项目，深入蛋白、寡糖、益生菌等营养研究领域，通过技术创新拓展研发成果。

蒙牛联合中国益生菌产业拓荒人、蒙牛益生菌研究团队首席专家张和平教授及其团队，累计穿越超 30,000 公里，奔赴6个省份20多个县市，共同打造人文生态主题及科研成果纪实类纪录片《寻菌之路》，展现中国本土益生菌的提取与研发过程，推动提升全民对益生菌及肠道健康的关注。