蒙牛乳业在成立之初就成立了党组织，2000年成立党支部，2001年5月成立党委。公司有员工49169名，设立7个基层党委、7个党总支、146个党支部，党员2720名。

蒙牛乳业党委坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，认真学习贯彻党的二十大精神，按照党中央的决策部署和中粮集团党组、呼和浩特市委的工作部署，坚持围绕中心、服务大局，大力弘扬伟大建党精神，认真贯彻落实新时代党的建设总要求和全国国有企业党的建设工作会议精神，积极探索混合所有制企业党建工作模式，持续打造“乳香伴着党旗飘”党建品牌，推动党建工作和生产经营深度融合，努力将党的政治优势、组织优势和群众工作优势转化为企业发展优势和竞争优势，推动公司早日实现“再创一个新蒙牛”的战略目标，成为世界一流乳企，以高质量党建引领保障企业高质量发展。

蒙牛乳业党委分别于2012年获得中粮集团创先争优先进基层党组织荣誉称号，2017年获得呼和浩特市先进基层党组织荣誉称号，2019年获得内蒙古自治区先进基层党组织荣誉称号、2021年获得中央企业先进基层党组织荣誉称号。